Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aqp4P55088 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Aqp4P55088 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms