Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad23aP54726 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad23aP54726 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad23aP54726 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad23aP54726 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad23aP54726 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad23aP54726 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad23aP54726 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad23aP54726 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad23aP54726 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms