Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fdft1P53798 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fdft1P53798 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms