Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RabggtbP53612 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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