Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efnb1P52795 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms