Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgd1P52734 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgd1P52734 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms