Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms