Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc4P51655 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc4P51655 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms