Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CntfP51642 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CntfP51642 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CntfP51642 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfP51642 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfP51642 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfP51642 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfP51642 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfP51642 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CntfP51642 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms