Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorcP51450 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorcP51450 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorcP51450 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RorcP51450 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RorcP51450 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RorcP51450 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RorcP51450 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RorcP51450 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RorcP51450 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorcP51450 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorcP51450 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms