Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxc13P50207 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms