Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cav1P49817 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cav1P49817 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms