Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5P49615 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms