Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtpreP49446 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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