Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cox8bP48772 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms