Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LmnaP48678 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LmnaP48678 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LmnaP48678 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LmnaP48678 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms