Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcd1P48410 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms