Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli1P47806 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms