Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capza1P47753 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms