Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax7P47239 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms