Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms