Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf1P46099 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf1P46099 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms