Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sipa1P46062 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms