Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms