Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ItgavP43406 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms