Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sept1P42209 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms