Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tac1P41539 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms