Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms