Protein–RNA interactions for Protein: P41139

Id4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Id4P41139 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Id4P41139 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Id4P41139 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Id4P41139 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Id4P41139 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Id4P41139 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Id4P41139 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Id4P41139 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Id4P41139 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Id4P41139 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Id4P41139 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Id4P41139 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Id4P41139 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Id4P41139 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Id4P41139 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Id4P41139 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms