Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TfamP40630 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TfamP40630 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TfamP40630 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TfamP40630 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TfamP40630 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TfamP40630 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TfamP40630 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TfamP40630 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TfamP40630 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TfamP40630 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms