Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ThpoP40226 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms