Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetP35546 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetP35546 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetP35546 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RetP35546 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetP35546 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetP35546 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetP35546 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetP35546 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetP35546 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RetP35546 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RetP35546 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RetP35546 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RetP35546 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RetP35546 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RetP35546 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RetP35546 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RetP35546 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetP35546 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetP35546 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetP35546 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetP35546 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetP35546 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetP35546 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetP35546 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetP35546 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetP35546 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetP35546 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetP35546 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms