Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TpoP35419 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TpoP35419 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TpoP35419 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TpoP35419 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms