Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab23P35288 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms