Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptk2P34152 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms