Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc10P31257 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms