Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms