Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnd1P30999 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms