Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msr1P30204 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms