Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp1P29452 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms