Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BgnP28653 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BgnP28653 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BgnP28653 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BgnP28653 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BgnP28653 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BgnP28653 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BgnP28653 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BgnP28653 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms