Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb1P28230 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms