Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms