Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ChgaP26339 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChgaP26339 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ChgaP26339 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ChgaP26339 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms