Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd247P24161 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd247P24161 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms