Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms