Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms