Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkchP23298 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrkchP23298 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkchP23298 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms