Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms