Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RarbP22605 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RarbP22605 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RarbP22605 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RarbP22605 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RarbP22605 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RarbP22605 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RarbP22605 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RarbP22605 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RarbP22605 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RarbP22605 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RarbP22605 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RarbP22605 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RarbP22605 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RarbP22605 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RarbP22605 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RarbP22605 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RarbP22605 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RarbP22605 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RarbP22605 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RarbP22605 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RarbP22605 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms